Activités du laboratoire de statistiques appliquées et d'informatique biomédicale

Laboratoire de statistiques appliquées et
d'informatique biomédicale

Laurent Gouthière (Ingénieur) - Direction Scientifique

Le laboratoire de statistiques appliquées et d'informatique biomédicale développe des méthodes d'analyse de données, des outils mathématiques, des traitements de données et prend part à des projets de recherche. Expert Soft Technologies (Le laboratoire de statistiques appliquées et d'informatique biomédicale) fait partie du pôle de recherche de l'Université de Caen et plus particulièrement du Laboratoire de recherche en activités physique et sportive (CRAPS/STAPS/INSERM de l'Université de Caen) et de l'institut régional de Médecine du sport (IRMS CHU of Caen). Le laboratoire a collaboré avec l'INSERM U347 de l'hôpital du Kremlin Bicêtre, le laboratoire de Radio-analyses et de Radio-Pharmacie des hospices civils de Lyon dans l'application de méthodes biostatistiques en Biologie moléculaire (Structure des télomères) et de Biochimie humaine (métabolisme de la Mélatonine). En 2009 le CRAPS/STAPS de Caen rejoint Mobilités: Cognition et Temporalité. EA3917, INSERM ERI 27. En 2013 il devient Mobilités, Attention, Orientation et Chronobiologie (UMR CRAPS/STAPS/INSERM U1075 Comète)

Historique :

Les publications scientifiques on rendu possible d'affiner et surtout de rendre publics les travaux en Chronobiométrie. En particulier les études remarquables de Jean de Prins, Pietro Cugini, Walter Nelson, Franz Halberg, Germaine Cornélissen, Christopher Bingham et leurs collaborateurs.

Dans ce contexte, Laurent Gouthière est un méthodogiste développeur et a travaillé sur les Systèmes Experts :

Gaudeau C., Gouthière L., Le Toullec C., Lawton E. and Chauvet G. (1990). Simulation Expert System for Physiological Mechanisms of the Space Motion Sickness. Life Sciences Research in Space, Trieste Italy, European Space Agency, ESA SP-307, 111-116.

(1, 2, 3, 4) Société de BioInformatique et de BioTechnologies, Tours, France, (1, 2) Conservatoire National des Arts et Métiers, Tours, France, (5) Laboratoire de Biologie Théorique, Université d'Angers, France.

Claude Gaudeau, Vero Rakotomalala, Laurent Gouthière, Eric Ravaud, Stéphanie Benoist (1996). Fuzzy Automata and Grammars: Manipulation of Uncertain Knowledge. Modeling Complex Data for Creating Information. Editors: Pr. Dr. Jacques Emile Dubois, Dr. Nahum Gershon. ISBN: 978-3-642-80201-0 (Print) 978-3-642-80199-0 (Online), Springer.

(1, 2, 3, 4, 5) Société de BioInformatique et de BioTechnologies, Tours, France, (1, 3) Conservatoire National des Arts et Métiers, Tours, France.

et sur l'approche analytique des phénomènes périodiques :

Gaudeau C., Gouthière L. (1992). Méthodologie d'analyse des rythmes dans les systèmes non linéaires. Les rythmes, lectures et théories. Converscienses, L'Harmattan. 31-56.

(1, 2) Société de BioInformatique et de BioTechnologies, Tours, France, (1, 2) Conservatoire National des Arts et Métiers, Tours, France

Dans le domaine des séries chronologiques, parmi les nouvelles méthodes de détéction des rythmes ou plus généralement des phénomènes périodiques, on peut citer : Le spectre elliptique inverse (SEI) et le spectre du pourcentage rythmique (SPR). Laurent Gouthière (Chercheur associé du CRAPS/STAPS/INSERM de l'Université de Caen) est membre de la société francophone de chronobiologie (SFC), de la société européenne des rythmes biologiques (EBRS) et de la société Française de Statistiques (SFdS)

Séminaires de recherche :

Gouthière L. (2003). Séminaire de recherche sur les approches pluridisciplinaires du mouvement humain et de la pratique sportive à l'UFR STAPS de Caen, (Statistical study of the analysis of a bioperiodic phenomenon). Chronobiométrie et méthodologie d'analyses des rythmes biologiques. UFR STAPS, March 27th 2003.

(1) Laboratoire de statistiques appliquées et d'informatique biomédicale (Expert Soft Tech.), Esvres, France.

Publications dans des revues à comité de lecture :

Mauvieux B., Gouthière L., Sesboüe B. et Davenne D. (2003). (Compared studies of the the circadian rhythms and the sleep actimetric reflect of sportive subjects and sedentariness subjects engaged in night-shift work). Etudes comparées des rythmes circadiens de la température et reflet actimétrique du sommeil de sportifs et sédentaires en poste régulier de nuit. Can J Appl Physiol. 2003 Dec;28(6):831-87. French. (PMID: 14992125) (Texte complet )

(1, 4) CRAPS/STAPS, UPRES EA 2131, Université de Caen, France, (2) Laboratoire de statistiques appliquées et d'informatique biomédicale (Expert Soft Tech.), Esvres, France, (3) Institut de recherche en Médecine du sport du CHU de Caen.

Deschatrette J., Ng KH, Gouthière L., Maigné J., Gerroui S. and Wolfrom C. (2004). Telomere dynamics determine episodes of anticancer drug resistance in rat hepatoma cells. Anticancer Drugs. 2004 Aug;15(7):671-8. (PMID: 15269598)

(1, 2, 4, 5, 6) INSERM U347, le Kremlin-Bicétre Hôpital, le Kremlin-Bicétre, France, (3) Laboratoire de statistiques appliquées et d'informatique biomédicale (Expert Soft Tech.), Esvres, France.

Gouthière L., Claustrat B., Brun J. et Mauvieux B. (2005). (Complementary methodological steps in the analysis of rhythms: search of periods, modelling. Examples of plasma melatonin and temperature curves). Eléments méthodologiques complémentaires dans l'analyse des rythmes: recherche de périodes, modélisation. Exemples de la Mélatonine plasmatique et de courbes de températures. Pathol Biol (Paris). 2005 Jun;53(5):285-9. Epub 2005 Jan 28. French. (PMID: 15939140) (Texte complet )

(1) Laboratoire de statistiques appliquées et d'informatique biomédicale, Esvres, France, (2, 3) Radio-Pharmacie et Radio-Analyse, Médecine nucléaire, Hôpital NeuroCardiologique, Lyon, France, (4) CRAPS/STAPS, UPRES EA 2131, Université de Caen, France.

Gouthière L., Mauvieux B., Davenne D. and Waterhouse J. (2005). Complementary methodology in the analysis of rhythmic data, using examples from a complex situation, the rhythmicity of temperature in night-shift workers. Biol Rhythm Res. 2005 July;36(3):177-193. (Texte complet )

(1) Laboratoire de statistiques appliquées et d'informatique biomédicale, (Expert Soft Tech.), Esvres, France, (2, 3) CRAPS/STAPS UPRES EA 2131, Université de Caen, France, (4) Research institute for sport and exercise sciences, John Moores University, Liverpool, UK.

Gouthière L., Mauvieux B. (2005). (Chronobiological Time Series, data quality and modelisation). Séries temporelles chronobiologiques : qualité des données, modélisation. Rythmes 2005 Dec;36(4):99-106.

(Texte complet )

(1) Laboratoire de statistiques appliquées et d'informatique biomédicale, (Expert Soft Tech.), Esvres, France, (2) CRAPS/STAPS UPRES EA 2131, Université de Caen, France.

Mauvieux B., Gouthière L., Sesboué B., Denise P. et Davenne D. (2007). (Effects of the physical exercise and sports on the circadian rhythm of temperature and waking/sleep pattern of the elderly person. Examples in retired and night workers) Effets de l'entraînement physique et sportif sur le rythme circadien de la température et le rythme veille-sommeil chez la personne vieillissante. Exemple chez des retraités et des travailleurs de nuit. Pathol Biol (Paris). 2007 Apr-May;55(3-4):205-7. Epub 2007 Mar 27. French. (PMID: 17391866) (Texte complet )

(1, 5) CRAPS/STAPS UPRES EA 2131, Université de Caen, France, (1, 2) Laboratoire de statistiques appliquées et d'informatique biomédicale, (Expert Soft Tech.), Esvres, France, (3) Regional institute of sport medicine (IRMS), CHU of Caen, France, (4) Laboratoire de Physiologie, CHU de Caen, France.

Gueugneau N., Mauvieux B., Papaxanthis C. (2008). Circadian modulation of mentally simulated motor actions: implications for the potential use of motor imagery in rehabilitation. Neurorehabil Neural Repair. 2009 Mar-Apr;23(3):237-45. Epub 2008 Oct 30. (PMID: 18974420)

(1, 3) INSERM ERIT-M207, Université de Bourgogne, France, (2) INSERM ESPRI EA 3917 Mobilités : Cognition et Temporalité, Université de Caen, France, (2) Laboratoire de statistiques appliquées et d'informatique biomédicale, (Expert Soft Tech.), Esvres, France.

Publications dans des livres :

Gouthière L., Mauvieux B. (2004). (Essential steps in the analysis of the rhythms: Quality of the experimental data, search for periods by spectral analysis of various principles, modelling). Etapes essentielles dans l'analyse des rythmes : Qualité des données expérimentales, Recherche de périodes par analyses spectrales de principes divers, Modélisation. XXXVème Congrès de la Société Francophone de Chronobiologie, Sur quelques aspects de la Chronobiologie. Publications de l'Université de Saint-Etienne (Jean Monnet), ISBN: 2-86272-342-8, July 2004.

(Texte complet )

(1) Laboratoire de statistiques appliquées et d'informatique biomédicale, (Expert Soft Tech.), Esvres, France, (2) CRAPS/STAPS UPRES EA 2131, Université de Caen, France.

Mauvieux B., Gouthière L., Sesboüe B. et Davenne D. (2004). (Comparative studies of the circadian rhythms and actimetric reflect of the sleep quality of sportive and sedentariness workers in night-shift work). Comparaisons des rythmes circadiens de la température et reflet actimétrique du sommeil de sportifs et de sédentaires en poste régulier de nuit. XXXVème Congrès de la Société Francophone de Chronobiologie, Sur quelques aspects de la Chronobiologie. Publications de l'Université de Saint-Etienne (Jean Monnet), July 2004. (Texte complet )

(1, 4) CRAPS/STAPS UPRES EA 2131, Université de Caen, France, (2) Laboratoire de statistiques appliquées et d'informatique biomédicale, (Expert Soft Tech.), Esvres, France, (3) IRMS, CHU de Caen, France.

Publication dans un magazine scientifique :

Larousserie D., Mauvieux B. (2005). Physiologie : Sport et travail de nuit (Physiology: Sport and night shift work). Sciences et Avenir. 2005 Dec;706:35.

(1) Sciences et Avenir magazine, France, (2) Laboratoire de statistiques appliquées et d'informatique biomédicale, (Expert Soft Tech.), Esvres France et CRAPS/STAPS UPRES EA 2131, Université de Caen, France.

Communications orales dans des congrès :

Gouthière L., Mauvieux B. (2003). (Essential steps in the analysis of the rhythms: Quality of the experimental data, search for periods by spectral analysis of various principles, modelling). Etapes essentielles dans l'analyse des rythmes : Qualité des données expérimentales, Recherche de périodes par analyses spectrales de principes divers, Modélisation. XXXVème Congrès de la Société Francophone de Chronobiologie, Faculté des Sciences et Techniques, Université de Saint-Etienne, France, du 10 au 12 Juin 2003. (Résumé )

(1) Laboratoire de statistiques appliquées et d'informatique biomédicale, (Expert Soft Tech.), Esvres, France, (2) CRAPS/STAPS UPRES EA 2131, Université de Caen, France.

Mauvieux B., Gouthière L., Sesboüe B., Davenne D. (2003). (Comparative studies of the circadian rhythms and actimetric reflect of the sleep quality of sportive and sedentariness workers in night-shift work). Etudes comparées du rythme circadien de la température et reflet actimétrique de la qualité du sommeil de sportifs et de sédentaires en poste de nuit. XXXVème Congrès de la Société Francophone de Chronobiologie, Université de Saint-Etienne, France, du 10 au 12 Juin 2003. (Résumé )

Gouthière L. (2003). Complementary methodological approach in the rhythms analysis : Quality, period, modelling (Approche méthodologique complémentaire dans l'analyse des rythmes : Qualité, période, modélisation). XIIIème Congrès de l'association de Chronobiologie Médicale, VTF Saint Sauves, La Bourboule, France, du 25 au 28 Septembre 2003. (Résumé )

(1) Laboratoire de statistiques appliquées et d'informatique biomédicale, (Expert Soft Tech.), Esvres, France.

Mauvieux B., Gouthière L., Sesboüe B., Davenne D. (2004). (Effects of physical and sportive training on the circadian rhythms of the night-shift workers). Effets de l’entrainement physique et sportif sur les rythmes circadiens du travailleur en poste régulier de nuit. XXXVIème Congrès de la Société Francophone de Chronobiologie, Université de Rennes, France. (Résumé ), (Texte complet )

Gouthière L., Wolfrom C. et Deschatrette J. (2004). (Reverse Elliptic Periodogram (REP): principle, interest, example of the periods of the cells proliferation rate of transformed human fibroblasts, HGK1 cells). Spectre Elliptique Inverse, principe, intérêt, exemple des périodicités de la vitesse de prolifération de fibroblastes humains transformés (cellules HGK1). XXXVème Congrès de la Société Francophone de Chronobiologie, Université de Rennes, France, du 17 au 19 Mai 2004. (Résumé ), (Texte complet )

(1) Laboratoire de statistiques appliquées et d'informatique biomédicale, (Expert Soft Tech.), Esvres, France, (2, 3) INSERM U347, Hôpital du Kremlin-Bicétre, France.

Mauvieux B., Gouthière L., Sesboué B., Denise P. et Davenne D. (2005). (Effects of the physical training and the sportive activity on the circadian rhythm of the temperature and the night and day rhythm for aging people. Example for retired and night workers). Effets de l'entrainement physique et sportif sur le rythme circadien de la température et le rythme veille-sommeil chez la personne vieillissante. Exemple chez des retraités et des travailleurs de nuit. XIVème Congrès de l'association médicale Française en Chronobiologie, Centre Paul Langevin, Aussois, France, du 10 au 13 Mars 2005. (Résumé )

(1, 5) CRAPS/STAPS UPRES EA 2131, Université de Caen, France, (2) Laboratoire de statistiques appliquées et d'informatique biomédicale, (Expert Soft Tech.), Esvres, France, (3) Institut régional de recherche en Médecine du sport (IRMS), CHU de Caen, France, (4) Laboratoire de Physiologie, CHU de Caen, France.

Mauvieux B., Gouthière L., Sesboué B. et Davenne D. (2005). (Effects of a regular sportive programme of training on the biological rhythms of the night workers). Effets de l'entraînement physique et sportif régulier sur les rythmes biologiques du travailleur de nuit. XXXVIIème Congrès de la Société Francophone de Chronobiologie, University of Strasbourg, France, du 18 au 20 Avril 2005. (Résumé )

(1, 5) CRAPS/STAPS UPRES EA 2131, Université de Caen, France, (1, 2) Laboratoire de statistiques appliquées et d'informatique biomédicale, (Expert Soft Tech.), Esvres, France, (3) Institut régional de recherche en Médecine du sport (IRMS), CHU de Caen, France.

Claustrat B., Frezet S., Gouthière L., Malan A., Brun J. and Claustrat F. (2005). Alteration of daily urine 6-sulfatoxymelatonin, plasma corticosterone and hepatic clock gene expression in the folate deficient CBA mouse. Xth Congress of the European Pineal and Biological Rhythms Society, September 1st-5th, 2005 - Frankfurt / Main, Germany. (Résumé )

(1, 2, 5, 6) Radio-Pharmacie et radio-analyse, Centre de Médecine nucléaire, Hôpital Neurocardiologique, Lyon, France, (3) Laboratoire de statistiques appliquées et d'informatique biomédicale, (Expert Soft Tech.), Esvres, France, (4) Neurobiologie des Rythmes CNRS Université Louis Pasteur, Strasbourg, France.

Mauvieux B., Gouthière L., Sesboüe B. and Davenne D. (2006). (Chronobiology and health of night workers : How physical and sportive training can slow down the phenomenon of desynchronization of the biological rhythms ?). Chronobiologie et santé des travailleurs de nuit : Comment l’entraînement physique et sportif peut ralentir le phénomène de désynchronisation des rythmes biologiques ? XXXXème Congrès de la société Francophone d'Ergonomie (SELF), du 11 au 13 Septembre 2006, Caen, France.

(1, 2, 4) CRAPS/STAPS UPRES EA 2131, Université de Caen, France, (1, 2) Laboratoire de statistiques appliquées et d'informatique biomédicale, (Expert Soft Tech.), Esvres, France, (3) Institut régional de recherche en Médecine du sport (IRMS), CHU de Caen, France.

Mauvieux B., Reinberg A., Gouthière L., Sesboüe B. and Davenne D. (2009). A 10 year span regular sport activity prevents rhythms desynchronisation of oral temperature and both hand grip strength in night workers. The third international congress of applied chronobiology and chronomedecine, May 17 – 22, 2009 Palm beach Hotel Akko (Acre) Israel. (Résumé )

(1, 5) ESPRI INSERM EA3917 - UFR STAPS, Université de Caen, France, (2) Unité de Chronobiologie, Fondation A. de Rothschild, Paris, France, (3) Laboratoire de statistiques appliquées et d'informatique biomédicale, (Expert Soft Tech.), Esvres, France, (4) Institut régional de recherche en Médecine du sport (IRMS), CHU de Caen, France.

Kaeffer B., Qi H., Matos R.J.B., Legrand A., Chauty A., Darmaun D., Morel F., Gouthière L., Bolaños-Jiménez F., Champ M., Rozé J.-C. (2009). Exfoliated epithelial cells, a source of information on clock genes expression by preterm infants to explore the onset of metabolic syndrome. XI Congress of the European Biological Rhythms Society, organized in association with the Japanese Society for Chronobiology, August, 22nd –28th, 2009 Strasbourg France (Résumé )

UMR 1280 INRA Nantes, France, except LG: Laboratoire de statistiques appliquées et d'informatique biomédicale, (Expert Soft Tech.), Esvres, France.

Communications affichées dans des congrès :

Mauvieux B., Gouthière L., Sesboüe B. et Davenne D. (2003). (Effects of a sportive programme of training on the biological rhythms and on the sleep quality in an extreme situation: Example of the regular night work). Les effets d'un programme d'entraînement sportif sur les rythmes biologiques et sur la qualité du sommeil en situation extrême : Exemple du travail régulier de nuit. Xème Congrès International des Chercheurs en Activités Physiques et Sportives, Paul Sabatier University, France, October 30-31, November 1st 2003. (Résumé ), (Poster )

Mauvieux B., LaRue J., Gouthière L., Sesboüe B. et Davenne D. (2004). (Influence of the level of physical training and sportive activity on the capacity to produce a focusing task for technicians in night-shift work). Influence du niveau d’entraînement physique et sportif sur la capacité à produire une tâche attentionnelle chez des techniciens en poste de nuit. Journées Nationales d’Etudes de la Société Française de Psychologie du Sport, UFR-APS de Grenoble, Grenoble, France, du 1 au 2 Avril 2004. (Résumé ), (Poster )

(1, 2, 5) CRAPS/STAPS UPRES EA 2131, Université de Caen, France, (3) Laboratoire de statistiques appliquées et d'informatique biomédicale, (Expert Soft Tech.), Esvres, France, (4) Institut régional de recherche en Médecine du sport (IRMS), CHU de Caen, France.

Mauvieux B., Gouthière L., Sesboüe B. et Davenne D. (2005). (Physical training and sportive activities effects on the biological rhythms and on the sleep quality of the night-shift workers). Effets de l'entraînement physique et sportif sur les rythmes biologiques et sur la qualité du sommeil des travailleurs de nuit. XIst International ACAPS Conference (Association des Chercheurs en Activités Physiques et Sportives), du 26 au 28 Octobre 2005, Paris, France. (Résumé ), (Poster )

Gueugneau N., Mauvieux B. et Papaxanthis C. (2005). (The mental image of movement and circadian influence: Is isochrony persistent throughout the day). Image mentale du mouvement et influence circadienne : L’isochronie est-elle persistante tout au long de la journée. XIst International ACAPS Conference, October 26-28 2005, Paris, France. (Poster )

(1, 3) INSERM ERM 207 Motivité-Plasticité, UFR STAPS, Université de Bourgogne, Dijon, France, (2) CRAPS/STAPS UPRES EA 2131, Université de Caen, France et Laboratoire de statistiques appliquées et d'informatique biomédicale, (Expert Soft Tech.), Esvres, France.

Mauvieux B., Gouthière L., Waterhouse J. et Davenne D. (2006). (Modeling by the method of the sliding window for the study of the dynamic variations of the circadian rythmicity of the temperature when the external synchronizers of the intern clock are disturbed: jet lag and constant routine). Modélisation par la méthode des fenêtres glissantes des variations dynamiques de la rythmicité circadienne de la température lorsque les synchroniseurs externes de l'horloge interne sont perturbés : jet lag et constant routine.. XXXVIIIème Congrès de la Société Francophone de Chronobiologie, du 9 au 11 Mai 2006, Lyon, France. (Poster )

(1, 2, 4) CRAPS/STAPS UPRES EA 2131, Université de Caen, France, (1, 2) Laboratoire de statistiques appliquées et d'informatique biomédicale, (Expert Soft Tech.), Esvres, France, (1, 3) Research institute for sport and exercise sciences, John Moores University, Liverpool, UK.

Clarisse R., Le Floc’h, N., Vallée O., Testu F. et Gouthière L. (2007). (Complementary methodological approaches in the analysis of the daily rhythmicity of attention in children 10 to 11 years old) Approches méthodologiques complémentaires dans l’analyse de la rythmicité de l’attention journalière de l’enfant de 10 à 11 ans. XXXIXème Congrès de la Société Francophone de Chronobiologie, Paris Muséum National d’Histoire Naturelle, France, du 19 au 21 Septembre 2007 Paris, France. (Résumé )

(1) EA 2114 Vieillissement et développement adulte, Université de Tours, (2) UPRES EA 3984 Processus Cognitifs et conduites Interactives, Université de Paris X Nanterre, (3) ERTe 1053 Aménagement des temps de vie et comportements humains, Université de Tours, (4) UR EA 3269 Laboratoire d’Analyse Spectroscopique et d’Energétique des Plasmas, Université d’Orléans, (5) Laboratoire de statistiques appliquées et d’informatique biomédicale, Expert Soft Tech. F-37320 Esvres, France.

Kaeffer B., Qi H., Matos R.J.B., Legrand A., Chauty A., Darmaun D., Morel F., Gouthière L., Bolaños-Jiménez F., Champ M., Rozé J.-C. (2009). Exfoliated epithelial cells, a source of information on clock genes expression by preterm infants to explore the onset of metabolic syndrome. XI Congress of the European Biological Rhythms Society, organized in association with the Japanese Society for Chronobiology, August, 22nd –28th, 2009 Strasbourg, France (Poster )

UMR 1280 INRA Nantes, except LG: Lab statistiques appliqués et informatique bio-médicale (Expert soft Tech.), Esvres.

Thèse :

Benoit Mauvieux, Soutenance de thèse de Docteur d'Université STAPS, le 3 Décembre 2004, Titre: (Effects of the regular physical and sporting training programme, chronic or temporary, on the biological rhythms in night-shift work). Effets d'un entrainement physique et sportif régulier, chronique ou temporaire, sur les rythmes biologiques du travailleur de nuit (Résumé )

Directeur de thèse : D. Davenne, Jury : D. Davenne (Professeur de l'Université de Caen), G. Falgairette (Professeur de l'Université de Toulon), J. Foret (Directeur du CNRS Caen), A. Muzet (Directeur du CNRS Strasbourg), A. Reinberg (Directeur du CNRS Paris), L. Gouthière (Ingénieur. Expert Soft Tech. Lab.)